司马绍当了三年皇帝，也死了。王导等人又拥戴五岁的皇太子司马衍即位。已经是“三朝元老”的王导遭遇了第三道坎：外戚争权。
司马绍考虑到继承人年幼，留下遗诏，由王导和小舅子、中书令庾亮一同辅政。司马衍即位，司马绍的皇后庾氏以皇太后身份临朝称制。庾亮仗着庾太后的势力，很快就把实权集中到了庾家手中。尽管王导荣光依旧，连皇帝对他下诏书都是用敬语，但王导离实权越来越远了。见惯荣辱浮沉的王导淡然处之。有人曾经向王导进谗，说庾亮可能举兵擅权，对王导不利，劝王导多加防备。王导说：“他若逼我，我就一身布衣服，回家养老去，有什么可怕呢？”庾亮倒没想要铲除王导，可他是个雄心勃勃又拥有很多想法的年轻人，屡屡指点江山，东晋政坛上出现了多次政治变动。王导秉承“清静为政”的理念，以不变应万变。朝廷一有动静，政治一有裂缝，他就上前和稀泥。
大臣们给晚年王导起了一个绰号：糊涂宰相。原因是王导每年考察官员的时候，都流于形式，考察的结果是你好他好大家好。有人有意见，王导就说，害国之鱼我们都能容忍，何必每年纠缠于那些小鱼小虾呢？的确，王导的一生连对威胁王朝利益的大问题都采取拖延、打太极的对策，让时间去消化它们，根本就没必要在每年的官员考核上较真。他晚年常说：“现在说我糊涂，只怕将来有人还要怀念我的糊涂呢！”